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新国标(GB 14922—2022)中明确指出了SPF级大小鼠需要进行的病原体检测种类。为满足新国标要求,上海翼和应用生物技术有限公司推出一系列SPF级大小鼠病原体检测试剂盒。翼和同时也为实验动物研究机构提供全方位的技术培训,助力其建立完整的检测技术中心。
SPF级大小鼠病原体质量控制多重qPCR检测试剂盒(2种常见病毒检测项目)
(探针法)
【产品规格】
SPF.M/R-CV-001 50 T/盒
【产品说明】
Biowing®SPF级大小鼠常见病毒qPCR检测试剂盒,针对实验小鼠易感的两种病毒小鼠肝炎病毒和小鼠诺如病毒而设计。
本试剂盒采用两套引物探针在FAM(小鼠肝炎病毒MHV)、HEX(小鼠诺如病毒MNV)两个通道检测两种病毒,另外采用一套引物探针在CY5通道检测内参RNA,该试剂盒具有以下特点:
灵敏:检测灵敏度较高,10 copies/μL可被有效检出。
稳定:全程闭管操作,无交叉污染。
可靠:含内参对照,避免假阴性。
方便:操作简单,一步法检测。
【运输及保存条件】
低温冷冻运输,-20℃保存,有效期1年;使用后仍存放在-20℃,不可反复冻融超过三次。
【产品组分】
A BOX:
组分名称 | 装量 |
Biowing®Virus qPCR Reaction Mix | 110 μL×2管 |
Biowing®Common Virus(MHV、MNV)
Primer&Probe Mix |
冻干粉×2管 |
RNase Free Water | 1.1 mL×2管 |
石蜡油 | 1.1 mL×1管 |
B BOX:
组分名称 | 装量 |
阳性质控(PC) | 冻干粉×2管 |
RNase Free Water | 1.1 mL×1管 |
注:
阳性质控(PC)包含3种病毒核酸或含特定片段的质粒DNA,分别是小鼠肝炎病毒MHV、小鼠诺如病毒MNV、内参RNA。
【操作步骤】
1. 样本制备
推荐配套使用翼和SPF-Level Mouse/Rat Pathgen DNA/RNA Kit Pro(货号:PRE.M/R-001),此试剂盒提取快速,回收率较高,并提供核酸保护剂(含内部质控),可以对提取过程进行质控,若使用其他提取试剂盒需先自行测试。
2. 产品组分的复溶
A BOX:Biowing®Required Virus Primer&Probe Mix先12,000 rpm离心5 min,按下表加入RNase Free Water,涡旋震荡1 min,瞬离5 s,室温放置5-10 min备用。
A BOX: | 每管需加入RNase Free Water量 |
Biowing®Common Virus(MHV、MNV)Primer&Probe Mix | 302 μL |
注:A、B BOX复溶分别用盒中所给的RNase Free Water,请勿混用、复用,避免污染;产品组分复溶后建议-20℃保存,反复冻融不超过三次,可分装后储存。 |
B BOX:阳性质控(PC)先12,000 rpm离心5 min,按下表加入RNase Free Water,涡旋震荡1 min,瞬离5s,室温放置5-10 min后备用。
B BOX: | 每管需加入RNase Free Water量 |
阳性质控(PC) | 44 μL |
注:A、B BOX复溶分别用盒中所给的RNase Free Water,请勿混用、复用,避免污染;阳性质控务必与A BOX分开保存,防止污染,复溶后立即通风并喷洒酒精,以防气溶胶污染;产品组分复溶后建议-20℃保存,反复冻融不超过三次,可分装后储存。 |
3. qPCR 反应液的准备
(1)根据所要检测样品的数量,计算所需反应孔数,每个样本做单孔。
反应孔数=1个阳性质控+1个阴性质控+样本数
(2)根据反应孔数计算所需的Biowing®Virus Probe qPCR Mix总量(需有1孔的加样损失量):
Biowing®Virus Probe qPCR Mix=(反应孔数+1)×15 μL
(3)各试剂放室温融化,并根据下表所示准备qPCR Mix:
组分/样品管 | Biowing®Virus qPCR Reaction Mix
(µL) |
Biowing®Common Virus(MHV、MNV)Primer&Probe Mix
(µL) |
总体积
(µL) |
1孔 | 4 | 11 | 15 |
N孔
(反应孔数+1) |
4N | 11N | 15N |
4. qPCR 反应体系及反应条件
(1)震荡混匀Biowing®Virus Probe qPCR Mix,低速离心,将管盖残留液体收集至管底。
(2)向每孔反应管中分装15 μL qPCR Mix。
(3)向分装过qPCR Mix的反应管中加入15 μL石蜡油。
(4)向反应管中加入样品,3,000 rpm 瞬离5 s,加样示例如下:
组分/样品管 | 待测样品管
(µL) |
阳性对照管
(µL) |
阴性对照管
(µL) |
Biowing®Virus Probe
qPCR Mix |
15 | 15 | 15 |
RNase Free Water | 0 | 0 | 5 |
Sample | 5 | 0 | 0 |
阳性质控(PC) | 0 | 5 | 0 |
PCR仪设置以宏石SLAN-96S为例,先新建并保存程序项目,选择定性/绝对定量模式,反应体系20 µL,选择FAM、HEX、CY5通道,按照下表设置程序进行保存:
步骤 | 循环数 | 温度 | 时间 | |
1 | 逆转录 | 1 | 55℃ | 15 min |
2 | 预变性 | 1 | 95℃ | 30 s |
3 | 变性 | 40 | 95℃ | 10 s |
退火与延伸 | 60℃ | 30 s | ||
60℃延伸时收集荧光信号 | ||||
通道选择:样本检测通道-FAM、HEX;内参检测通道-CY5。宏石SLAN-96S荧光定量 PCR 仪不需 ROX 校准。若存在部分荧光定量PCR仪无CY5通道,即不分析该通道。 |
【阈值设置】
以宏石SLAN-96S为例,常用选项中扩增曲线算法选择相对荧光值法-log,基线设置3-15个循环。
(1)按照机器的自动阈值或者手动调整阈值线将阳性质控(PC)各通道的Ct值定为≤32,根据该阈值线进行检测样本结果的判定。
【结果判读】
以宏石SLAN-96S为例,根据样本(FAM/HEX)Ct值判定是否发生病毒感染,具体标准如下:
PCR 模板 | 样本(FAM/HEX) | 判定说明 |
阳性对照 | ≤32 | 阳性成立 |
>32 | 阳性不成立 | |
待测样品 | >40 | 阴性成立 |
≤40 | 阳性成立 |
注:
(1)FAM通道Ct值≤40时,样本感染小鼠肝炎病毒。
(2)HEX通道Ct值≤40时,样本感染小鼠诺如病毒。
(3)不同机器的检测灵敏度不同,不同类型样本性质不同,建议使用该系列试剂盒检测样本前,利用SPF样本进行适应性验证后制定阳性判断标准。
【注意事项】
由于PCR反应非常灵敏,实验操作中应注意以下事项,以免发生核酸污染。
(1)A区:(洁净区)配制Mix和qPCR阴性加样,建议在超净工作台完成,并配套干净器具及无菌无酶耗材专用于体系配制。
(2)B区:(核酸提取及加样区)样本DNA/RNA提取,建议在超净工作台完成,若无超净工作台请通风状态下提取并立即消杀,需配套专用于核酸提取的器具,并在每次提取后对环境和器具进行核酸消杀处理;加样区,按照先加待测样本,后加阳性对照的顺序加样,在qPCR反应板上阳性对照的排布应远离待测样本孔和阴性对照;同样需配套专用于加样的仪器,并在每次加完样后进行核酸消杀处理。
(3)C区:(核酸扩增区)此区域放置荧光定量PCR仪及相关电脑进行数据处理,同样需定期进行核酸消杀。
(1)由于B BOX含阳性质控,为避免试剂受到核酸污染,A、B BOX请分开储存。
(2)每个组分在使用前都应先低速离心后小心开启。使用时请上下轻柔颠倒十次混匀,避免起泡,并低速短暂离心后使用。
(3)qPCR反应板封膜或盖盖子时需反复压紧。
(4)上机扩增前,反应管短时低速离心,将管壁液体收集至管底。
(5)盖上反应管盖子或者贴上光学膜后,为避免影响荧光信号读取,请注意不要在管盖或者膜上做标记,或者用刮板反复摩擦。
有技术问题,欢迎电话咨询:021-33559491
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